本会于1982年8 月4日获准注册成立,但据新加坡南安会馆会史记载,早在1946年,会长周献瑞等就曾发起组织“马来西亚南安总会”,得到马六甲、吉隆坡、巴布巴辖、槟城等地南安会馆的热烈响应。尔后,在新加坡正式成立了“马来西亚南安总会”,立会宗旨为“团结全南洋南安邑人,发展家乡建设事业”。创会后,总会曾集资派人回乡建造英都至安海公路。后因马中两地局势动荡,会务终告停顿。
至1970年,在雪兰莪南安会馆常年会员大会上,有会员提出创组联合会,与会者纷纷附议。在众乡贤推动下,1979年筹组工作开始,进展顺利。1982年8月14日召开了南联会第一次会员大会,选举第一届理事会,雪兰莪南安会馆尤人俊会长出任首届联会会长。
本会理事会每两年改选一次,逢改选时期,各地属会轮流承办。目前,本会属会共有22个,遍布全马各地,远至沙巴。各地属会,经常组团到各乡团会馆进行交流访问,以联络乡谊,促进会务,加强团结。历十多年发展,南联会已有效地促进全马各地的南安会馆连城一气,南安同乡的团结更加紧密。
本会创立后即组建了青年团,开展了许多有益的活动,为发扬光大南安精神,促进马华社会的发展,做出了可喜的建树。本会妇女组正在筹建中。
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